Saga de Namek et de Freezer : Quand il partit pour Namek, il s’entraîna avec une gravité intense pouvant aller jusqu’à 100x la gravité de la planète Terre. À son arrivé, il combattu le commando Ginyu et battu Recoome, Burter et Jeice, mais Jeice s’enfuit et Recoome et Burter furent achevés par Vegeta. Jeice alla chercher le Capitaine Ginyu qui vaincu San Goku en échangeant leur corps. À la fin, San Goku reprit son corps, mais fut gravement blessé. Vegeta le mit dans une machine de régénération. Après s’être remis de ses blessures, il alla combattre le tyran freezer auquel il aura beaucoup de mal à vaincre. Il devra surpasser ses limites en atteignant le Kaïoken 20x plus puissant, mais aussi créer un énorme Genkidama qui ne marchera pas complètement sur lui car il survécu et en profita pour blesser gravement Piccolo et tuer Krilin en le faisant exploser. San Goku en colère à cause des tueries sans pitié de Freezer finit par devenir fou de rage et se transforma en Super Saïyen. Sous cette forme, il devint plus fort que freezer et alors un combat sanguinaire commença. Pendant le combat, Freezer essayera de détruire la planète, mais n’arriva qu’à gravement l’endommager, par contre il ne resterait plus que 5 minutes avant quelle n’explose. San Goku finit par le vaincre en le coupant en 2 (il fera une feinte pour que freezer se fasse tuer par sa propre technique). Freezer demanda pitié à San Goku qui par son cœur pur ne pu refuser, il lui donna une partie de son énergie pour qu’il puisse survivre. Mais Freezer l’attaqua et San Goku le mit hors d’état de nuire (mais il ne le tua pas).San Goku s’enfuit ensuite dans une capsule du Commando Ginyu, il resta environ un an sur la planète des yardrats ou il apprit une nouvelle technique. Pendant qu’il était sur Yardrat, Bulma ressuscita les guerriers de la Z team morts pendant le combat contre les saïyens. Quand il revint sur Terre, il rencontra Trunks qui (juste avant que San Goku n’arrive) tua Freezer robotiser et son père. Trunks affronte San Goku en combat singulier et le résultat est que San Goku est incroyablement plus fort que lui. Il apprend qu’il est supposé mourir dans moins d’un an à cause d’une maladie au coeur. Mais Trunks lui apprend aussi qu’il vient du futur dans 20 ans, il lui donne un antidote pour qu’il guérisse et que le futur soit changé. Mais il lui apprend surtout que 2 cyborgs arriveront dans 3 ans et qu’ils devront s’entraîner énormément pour les vaincre. C’est alors que San Goku où plutôt Piccolo (car il avait entendu la conversation de loin à cause de son ouie) après en avoir parler à ses amis allèrent tous s’entraîner dans leur coin pour la grande bataille.

Saga des cyborgs et de Cell : Après 3 années d’entraînement, les cyborgs arrivèrent, mais San Goku ne pu se battre à cause de sa maladie au coeur qui arriva plus tard que prévu. San Goku revint peu après que Cell soit arrivé. Il prit San Gohan, Vegeta et Trunks (Trunks est revenu du futur pour aider San Goku à vaincre les cyborgs) pour aller s’entraîner dans la salle de l’esprit et du temps. Quand il sortit, il était capable de rester constamment super saïyen (ce niveau s'appelle super saïyen puissance maximale). Au tournoi de Cell (Cell a organiser lui-même un tournoi du monde des arts martiaux), San Goku s’est bien battu contre Cell, mais ne fera finalement pas le poids. Quand Cell essaya de détruire la Terre, San Goku se sacrifia en se téléportant juste avant l’explosion sur la planète de maître Kaïo.

Saga de Boo : Il passa 7 ans au Ciel avant de retourner sur terre (encore mort) pour participer au championnat des arts martiaux. Au championnat il rencontrera Kaïoshin et le suivra jusqu’à un vaisseau ou Vegeta sera contrôlé par le magicien Babidi. San Goku eut à nouveau à affronter Vegeta en super saïyen 2, mais fut interrompu par l’apparition de Boo. Vegeta l’assomma pour aller attaquer Boo seul et ainsi réparer ses tords. Quand il reprit ses esprits, Vegeta fut déjà tué par Boo. Il apprit la danse de la fusion à San Goten et Trunks. Quand il affronta Boo il devint super saïyen 3, mais il arrêta lui-même le combat. Quand il eut à retourner au ciel, il alla plutôt rejoindre San Gohan au Kaïoshinkaï. Le Kaïoshin d’il y a 15 générations lui donna sa vie. San Goku revint sur Terre pour affronter Boo en usant de la fusion des Potalas. Mais San Gohan fut absorbé par Boo, San Goku se téléporta au coté de Vegeta (qui put retourner dans le monde des vivants mais pas ressusciter).Ils fusionnèrent et eurent longtemps l’avantage sur Boo, mais ils ce laissèrent absorber pour aller chercher les autres dans son corps. Dans le corps la fusion fut arrêtée par sa force maléfique. Quand ils ressortirent ils se téléportèrent au Kaïoshinkaï. Là San Goku combattu une dernière fois Boo en super saïyen 3, mais ne fut finalement pas le poids il fera donc un Genkidama qui rassemble la force de tous les terriens, mais aussi les membres de la Z team. Goku n’avait plus assez de force pour tenir tête à Boo, mais Dendé grâce aux Dragon Balls demanda le vœu que San Goku retrouve toute sa force. Alors San Goku devint finalement super saïyen et utilisa le genkidama pour désintégrer Boo sans laisser en miette. Mais avant de le tuer San Goku demanda qu’il se réincarne en un être bon pour pouvoir se battre contre lui un jour seul sans l’aide de personne. 10 ans plus tard, pendant le tournoi de arts martiaux, il remarqua un jeune garçon chétif et inoffensif et vu tout de suite que c’était la réincarnation de Boo. D’ailleurs le garçon s’appelait Oob, le contraire de Boo. Quand San Goku le combattu, il vu grâce à son immense potentiel qu’il était réellement la réincarnation de Boo. Il décida alors de l’entraîner pour se battre contre lui un jour avec son plein potentiel.